1987년 3월 1일 연구소 설립, 초대 연구소장 최시원 교수
1989년 3월 1일 2대 연구소 소장 박재열 교수 취임
1989년 3월 1일 <연세음악연구> 창간호 출판
1993년 3월 1일 3대 연구소 소장 나인용 교수 취임
1999년 3월 1일 4대 연구소 소장 홍세원 교수 취임
1999년 9월 1일 연구소 홈페이지 개설
1999년 10월 23일 추계학술심포지엄 <21세기 교회음악의 진로>
2000년 11월 11일 추계학술심포지엄 <한국창작오페라의 어제와 오늘>
2001년 11월 3일 추계학술심포지엄 <한국 음악학 관련 학회의 현황과 조망>
2002년 9월 14일 추계학술심포지엄 <모차르트>
2003년 10월 25일 추계학술심포지엄 <음악에서의 크로스오버 현상과 실제>
2006년 4월 30일 연세대학교 음악대학 50년사 출판
2007년 3월 1일 5대 연구소 소장 곽동순 교수 취임
2007년 11월 24일 추계 국제학술심포지엄 <즉흥연주의 이론과 실제>
2008년 10월 30일-11월 4일 <메시앙 페스티발 2008 서울> 및 추계국제학술심포지엄
2009년 10월 11일-17일 <헨델 페스티발 2009 서울> 및 추계국제학술심포지엄
2010년 10월 28일-31일 <슈만 페스티발 2010 서울>및 추계학술심포지엄
2011년 11월 11일-15일 <리스트 페스티발 2011 서울> 및 추계국제학술심포지엄
2012년 3월 1일 6대 연구소 소장 송무경 교수 취임
2014년 4월 29일-5월 16일 인문학 강좌 <인문학적 시각으로 본 음악> 개설
2015년 3월 1일 7대 연구소 소장 유범석 교수 취임
2015년 3월 17일-6월 19일 인문학 강좌 <인문학강좌 2015 Humanity Lecture Series>
2017년 11월 7일-19일 <연세 바로크 뮤직 페스티벌> 및 추계학술심포지엄
2018년 3월 1일 8대 연구소 소장 신동일 교수 취임
2018년 11월 8일-11일 <연세 바로크 뮤직 페스티벌> 및 추계학술심포지엄
2019년 11월 20일 <연세음악 100년의 비상(飛上): 1914-1954> 음악회 및
추계학술심포지엄
2020년 3월 1일 9대 연구소 소장 송무경 교수 취임
2022년 4월 30일춘계학술심포지엄 <연주학으로의 실증주의적 접근: 초견에서 해석까지> 개최
2022년 11월 12일 춘계학술심포지엄 <연주학의 다양한 실체> 개최
2023년 3월 3일 <2023 니꼴라 싸니 초청 포럼 및 콘서트> 및 춘계 학술심포지엄
